피고가 2013. 2. 12. 원고에 대하여 한 별지1 목록 기재 등록세 및 지방교육세 부과처분을 취소한다.

2. 위 당사자 사이의 소송총비용 중 보조참가로 인한 부분은 피고보조참가인이, 나머지는 피고가 각 부담한다.

원고는 피고를 상대로, 피고가 2013. 2. 12. 원고에 대하여 한 취득세, 등록세, 지방교육세 및 농어촌특별세 부과처분 전부의 취소를 구하는 소를 제기하였으나, 제1심 법원은 원고의 청구를 모두 기각하는 판결을 선고하였고, 이에 대하여 원고가 항소를 제기하여 환송 전 당심은 취득세, 농어촌특별세 부과처분을 취소하고 나머지 청구를 기각하였다. 이에 대하여 원고와 피고가 상고를 제기하였는데, 환송판결은 피고의 상고를 기각하고 원고의 패소 부분인 등록세 및 지방교육세 부과처분 부분을 파기환송 하였으므로, 원고의 청구 중 취득세와 농어촌특별세 부과처분 취소청구는 원고 승소로 확정되었다.

따라서 환송 후 이 법원의 심판대상은 확정되지 아니한 등록세 및 지방교육세 부과처분 취소 청구 부분에 한정된다.

2. 기초사실

가. 대주건설 주식회사의 토지매입과 이전등기 대주건설 주식회사(이하 '대주건설'이라 한다)는 광주 광산구 수완동 970 대 26,950.8㎡(이하 '이 사건 토지'라 한다) 지상에 광주 광산구 대주피오레 아파트(442세대(이하 '이 사건 아파트'라 한다)를 신축하는 사업과 관련하여 2004. 12. 20. 한국토지공사로부터 위 토지를 매수하였는데, 위 토지는 당시 토지개발사업 시행 중이어서, 2009. 3. 2.에야 한국토지공사 명의의 소유권보존등기가 이루어졌고, 2009. 4. 24. 대주건설 명의의 소유권이전등기가 이루어졌다.

나. 원고의 대주건설에 대한 주택분양보증채무 약정

원고는 2006, 8. 29. 대주건설과, 대주건설이 이 사건 토지에 건설·공급하는 이 사건 아파트의 수분양자들에 대한 분양계약상 채무와 관련하여 주채무자를 대주건설로, 보증금액을 60,585,840,000원으로, 보증기간을 입주자 모집공고 승인일부터 소유권보존등기일(사용검사포함)까지로, 보증채권자를 주채무자와 주택분양계약을 체결한 자(분양권 양수자를 포함한다)로 하는 내용의 보증채무 약정(이하 '이 사건 주택분양보증약정'이라 한다)을 하고 2006. 8. 30. 대주건설에게 다음과 같은 내용의 주택분양보증서를 발급하였다.

[주택분양보증약관]

다. 대주건설의 양도각서 교부

원고는 2006. 8. 29. 대주건설로부터 다음과 같은 내용의 양도각서를 교부받았다. (이하 위 양도각서에 기한 양도약정을 '이 사건 양도계약'이라 한다).

[양도각서]

라. 원고와 대주건설의 주택분양신탁계약 체결

원고는 2008. 10. 6. 대주건설과 이 사건 토지에 건설·공급하는 이 사건 아파트의 신축공사와 관련하여 다음과 같은 내용의 주택분양신탁계약(이하 '이 사건 신탁계약'이라 한다)을 체결하였다.

[주택분양신탁계약서]

마. 원고의 주택분양보증채무 이행원고는 대주건설의 자금난으로 공사가 중단되어 보증채권자인 분양계약자들이 원고에게 보증사고 발생 신고와 함께 보증채무이행을 청구하자, 보증사고로 처리하고 2009. 3. 13.까지 303세대 분양계약자들에게 환급금 합계 26,094,775,000원을 지급하였다.

바. 이 사건 아파트에 대한 소유권이전등기 경료

원고는 2009. 4. 24. 이 사건 토지에 관하여 대주건설 명의로 소유권이전등기가 이루어지자 같은 날 이 사건 신탁계약에 따라 원고 앞으로 신탁을 원인으로 한 소유권이전등기를 마쳤고, 그 지상에서 건축 중이던 이 사건 아파트에 관하여 부동산처분금지 가처분 결정을 받아 그에 따른 등기촉탁에 기하여 대주건설 명의로 소유권보존등기를 마친 다음, 이에 터 잡아 2010. 4. 9. 이 사건 양도계약에서 정한 약정을 원인으로 원고 명의로 소유권이전등기를 마쳤으며, 같은 날 이 사건 아파트와 관련하여 과세표준을 감정가액인 27,143,335,830원으로 계산하고 여기에 등록세율 50%를 감면하여 산출한 등록세 등 325,720,020원을 신고·납부하였다.

그 후 원고는 2010. 4. 14. 대방건설 주식회사 앞으로 이 사건 토지와 이 사건 아파트에 관한 소유권이전등기를 마쳐주었다.

사. 피고의 등록세 및 지방교육세 부과처분

피고보조참가인은 2012. 11. 15. 피고에게 이 사건 아파트의 등록세 과세표준액을 보증환급금 26,094,775,000원과 압류권자에 대한 지급액 2,453,862,522원을 기준으로 28,551,497,522원으로 확정한 다음, 이를 기초로 이 사건 아파트에 대하여 미분양분과 분양분을 구분하여 추가 과세하라는 내용의 세무조사결과를 통지하였다.

이에 따라 피고는 2013. 2. 12. 원고에게 이 사건 아파트와 관련하여 보증환급금 및 압류권자에 대한 지급액을 과세표준액으로 하고 분양계약된 건축물분 등록세는 50% 감면하여 1%의 세율로, 미분양분은 2%의 세율로 산출하여 별지1 목록 기재와 같이 등록세 및 지방교육세 185,161,160원을 부과고지(이하 '이 사건 등록세 등 부과처분'이라 한다)하였다.

아. 전심절차

원고는 2013. 4. 3. 이 사건 등록세 등 부과처분에 불복하여 조세심판원에 심판을 청구하였으나 2013. 7. 16. 기각되었다.

[인정근거] 다툼 없는 사실, 갑 제1호증의2, 제2호증의2, 제3호증의2, 제4호증의2, 제5호증의 3, 제7호증의 1, 2, 제8호증의 1, 2, 제9호증의3, 제13호증의2, 제14호증의2의 각 기재, 변론 전체의 취지

3. 원고의 주장 및 관계 법령

가. 원고의 주장 요지

1) 등록세 및 지방교육세의 과세표준 산정 오류

피고는 이 사건 아파트에 관하여 원고의 수분양자에 대한 환급금액과 압류권자에 대한 지급금액의 합계액을 장부상 인정되는 사실상의 취득가액으로 보아 이를 등록세의 과세표준으로 하여 등록세 및 지방교육세를 부과하였으나, 원고가 수분양자에게 환급금을 지급한 것은 분양보증 채무를 이행한 것이고, 이 사건 양도계약상 원고의 이 사건 아파트에 대한 소유권이전등기청구권은 보증사고의 발생을 정지조건으로 하여 취득한 것이므로 환급이행금을 '이 사건 아파트의 취득을 위하여 실질적으로 지급하였거나 지급할 금액이라고 볼 수 없다.

또한 등록세의 과세표준을 등기 당시 확정되지 않은 원고의 주채무자에 대한 채권액에 의존하도록 하거나 보증채무의 이행방법에 따라 환급이행시에는 환급이행금을, 분양이 행시에는 시가표준액을 과세표준으로 하는 것은 과세요건 명확의 원칙에 반한다.

따라서 법인장부에 기재되는 환급금액이나 압류권자에 대한 지급금액은 '사실상의 취득가액이 될 수 없다.

나) 등록세율 적용 오류

피고는 유상취득의 등록세율 2%를 적용하여 등록세를 부과하였는데, 이 사건 아파트의 취득은 무상취득에 해당하므로 무상취득에 해당하는 세율인 1.5%를 적용하여야 한다.

나. 관계 법령

별지2 기재와 같다.

4. 처분의 적법 여부

가. 이 사건 아파트의 취득이 무상취득에 해당하는지 여부

1) 신탁법상의 신탁은 위탁자가 수탁자에게 특정한 재산권을 이전하거나 기타의 처분을 하여 수탁자로 하여금 신탁 목적을 위하여 그 재산권을 관리 처분하게 하는 것으로서 수탁자는 위와 같이 재산권을 이전받기 위하여 따로 대가를 출연하는 것이 아니므로, 수탁자가 신탁재산을 이전받아 그에 관한 소유권이전등기를 마쳤다면 이는 구 지방세법(2010. 3. 31. 법률 제10221호로 전부개정되기 전의 것, 이하 같다) 제131조 제1항 제2호에 정한 '제1호 이외의 무상으로 인한 소유권의 취득에 해당한다고 보아야 한다. 그리고 무상으로 인한 소유권의 취득에 해당하는지 여부는 등기신청서 또는 등 기부의 형식적인 기재에 불구하고 등기원인 또는 권리관계의 실질에 따라 판단하여야 한다.

2) 이 사건 기초사실 및 변론 전체의 취지를 통하여 알 수 있는 다음과 같은 사정, 즉 ① 이 사건 양도계약은 이 사건 주택분양보증약정으로 발생할 수 있는 원고의 채권을 담보하기 위한 것인데, 그 후 원고와 대주건설 사이에 이 사건 토지와 이 사건 아파트 등을 대상으로 하는 이 사건 신탁계약을 체결하였고 그 목적 역시 이 사건 주택분양보증약정으로 발생할 수 있는 원고의 채권을 담보하기 위한 것인 점, ② 이 사건 신탁계약에서는 이 사건 토지와 더불어 그 지상에서 건축 중인 이 사건 아파트 역시 신탁재산으로 하고 있고, 이 사건 토지에 관하여 이 사건 양도계약이 아닌 이 사건 신탁계약을 원인으로 소유권이전등기가 경료된 점, ③ 원고가 이 사건 아파트에 대하여 부동산처분금지가처분 결정을 받을 당시에는 이 사건 아파트가 완공되지 아니하여 신탁을 원인으로 한 소유권이전등기를 경료할 수 없어 부득이 가처분과 그에 기한 소유권이전등기과정에서 이 사건 양도계약에 의한 약정을 취득원인으로 내세운 것으로 보이고, 원고가 이 사건 아파트를 처분한 후에도 여전히 이 사건 신탁계약에서 정한 바에 따라 그 처분금액을 일정한 순서에 따라 정산할 의무를 부담하는 점 등을 종합하여 보면, 원고가 대주건설로부터 이 사건 아파트에 관한 소유권이전등기를 이전받은 것은 수탁자의 지위에서 이 사건 신탁계약에서 정한 바에 따라 신탁부동산을 관리·운용·처분을 하기 위한 것으로 봄이 타당하다. 그렇다면 이 사건 아파트에 관한 원고 명의의 소유권이전등기의 등기원인의 실질은 이 사건 신탁계약으로 볼 수 있으므로, 앞서 본 법리에 비추어 구 지방세법 제131조 제1항 제2호에서 정한 '제1호 이외의 무상으로 인한 소유권의 취득'으로 인한 등기로 볼 수 있다.

나. 등록세의 과세표준 및 등록세율

구 지방세법 제130조에 따르면, 등록세의 과세표준은 조례로 정하는 바에 따라 등록자의 신고에 따르고, 신고가 없거나 신고가액이 시가표준액에 미달하는 경우에는 시가표준액을 과세표준으로 한다. 다만 구 지방세법 제111조 제5항에 해당하는 경우에는 사실상의 취득가격을 과세표준으로 하게 되는데, 위 조항에서는 무상취득으로 인한 취득을 제외하고 있어, 무상취득의 경우 사실상의 취득가격이 아닌 등록자의 신고에 따른 금액 또는 시가표준액을 과세표준으로 하여야 한다. 또한 구 지방세법 제131조 제1항 제2호에서 부동산을 무상으로 취득한 경우의 등록세율을 부동산가액의 1.5%로 정하고 있다.

원고의 이 사건 아파트의 취득이 무상취득임은 앞서 본 바와 같은바, 원고의 신고에 따른 금액 또는 시가표준액이 아닌 사실상 취득가액인 수분양자들에 대한 환급금과 압류권자에게 지급한 대금을 과세표준으로 하고 유상취득의 등록세율인 2%를 적용하여 등록세를 부과하고 이와 같이 산정한 등록세를 바탕으로 지방교육세를 부과한 피고의 이 사건 등록세 등 부과처분은 위법하다.

5. 결론

그렇다면, 환송판결로 확정된 부분을 제외한 나머지 부분인 이 사건 등록세 등 부과처분의 취소 청구는 이유 있어 이를 인용할 것인바, 제1심 판결 중 이 부분에 해당하는 원고 패소부분은 이와 결론이 달라 부당하므로 이를 취소하고 이 사건 등록세 등 부과처분을 취소하기로 하여 주문과 같이 판결한다.

판사최현정

판사한종환

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